Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRSAM1Q6UWE0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRSAM1Q6UWE0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRSAM1Q6UWE0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms