Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SFXN4Q6P4A7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFXN4Q6P4A7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms