Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MCTP1Q6DN14 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms