Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNS3Q68CZ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNS3Q68CZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNS3Q68CZ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms