Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM104BQ5XKR9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM104BQ5XKR9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM104BQ5XKR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms