Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD13Q5VXD3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms