Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3BQ5T9A4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3BQ5T9A4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms