Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LDLRAD1Q5T700 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LDLRAD1Q5T700 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LDLRAD1Q5T700 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms