Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX1Q5SQQ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms