Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD3Q5JSP0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD3Q5JSP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms