Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL12Q53G59 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms