Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3BQ502W6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VWA3BQ502W6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3BQ502W6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms