Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TWISTNBQ3B726 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TWISTNBQ3B726 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TWISTNBQ3B726 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms