Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1AQ15573 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1AQ15573 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1AQ15573 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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