Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3A2Q15428 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SF3A2Q15428 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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