Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.02■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.01■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
GAPVD1Q14C86 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
GAPVD1Q14C86 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GAPVD1Q14C86 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
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