Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF3Q14653 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF3Q14653 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF3Q14653 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF3Q14653 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF3Q14653 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF3Q14653 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF3Q14653 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF3Q14653 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF3Q14653 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF3Q14653 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF3Q14653 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF3Q14653 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF3Q14653 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF3Q14653 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF3Q14653 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF3Q14653 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF3Q14653 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF3Q14653 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF3Q14653 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF3Q14653 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF3Q14653 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF3Q14653 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF3Q14653 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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