Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM25Q14258 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM25Q14258 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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