Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC3Q14003 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC3Q14003 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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