Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 25
TRA2AQ13595 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 25
TRA2AQ13595 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 25
TRA2AQ13595 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-7■■■■□ 25
TRA2AQ13595 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-7■■■■□ 25
TRA2AQ13595 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-7■■■■□ 25
TRA2AQ13595 MIER1-210ENST00000479067 745 ntTSL 53.95□□□□□ -1.781e-7■■■■□ 25
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TRA2AQ13595 GPS2-204ENST00000571098 1045 ntTSL 220.49■□□□□ 0.872e-10■■■■□ 24.8
TRA2AQ13595 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-10■■■■□ 24.8
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TRA2AQ13595 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-10■■■■□ 24.8
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TRA2AQ13595 SNRPD1-204ENST00000582475 723 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-10■■■■□ 24.8
TRA2AQ13595 GPS2-202ENST00000389167 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-10■■■■□ 24.8
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TRA2AQ13595 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-10■■■■□ 24.8
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TRA2AQ13595 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 24.2
TRA2AQ13595 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 24.2
TRA2AQ13595 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 24.2
TRA2AQ13595 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 24.2
TRA2AQ13595 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 24.2
TRA2AQ13595 SMARCC2-214ENST00000552674 3730 ntTSL 27.95□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 24.2
TRA2AQ13595 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-7■■■■□ 24.1
TRA2AQ13595 MBTD1-202ENST00000405860 3224 ntTSL 511.34□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 24.1
TRA2AQ13595 MBTD1-206ENST00000591270 2163 ntTSL 25.47□□□□□ -1.532e-7■■■■□ 24.1
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TRA2AQ13595 LINC01146-202ENST00000553929 413 ntTSL 34.32□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 24.1
TRA2AQ13595 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)5.32□□□□□ -1.565e-7■■■■□ 24.1
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TRA2AQ13595 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.11□□□□□ -1.595e-7■■■■□ 24.1
TRA2AQ13595 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 53.91□□□□□ -1.785e-7■■■■□ 24.1
TRA2AQ13595 USO1-203ENST00000512893 577 ntTSL 44.73□□□□□ -1.656e-6■■■■□ 24.1
TRA2AQ13595 DHX16-203ENST00000415603 892 ntTSL 317.27■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 24
TRA2AQ13595 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 24
TRA2AQ13595 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.644e-7■■■■□ 24
TRA2AQ13595 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.744e-7■■■■□ 24
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