Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA5AQ13591 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA5AQ13591 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA5AQ13591 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms