Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSAMPQ13449 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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