Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC4Q13426 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC4Q13426 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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