Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140Q13342 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140Q13342 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140Q13342 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140Q13342 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140Q13342 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140Q13342 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP140Q13342 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP140Q13342 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP140Q13342 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP140Q13342 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP140Q13342 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP140Q13342 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP140Q13342 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP140Q13342 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP140Q13342 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP140Q13342 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SP140Q13342 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP140Q13342 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP140Q13342 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP140Q13342 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP140Q13342 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140Q13342 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140Q13342 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140Q13342 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140Q13342 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140Q13342 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140Q13342 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140Q13342 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140Q13342 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140Q13342 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140Q13342 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140Q13342 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP140Q13342 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP140Q13342 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP140Q13342 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140Q13342 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140Q13342 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140Q13342 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140Q13342 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140Q13342 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140Q13342 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140Q13342 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140Q13342 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140Q13342 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140Q13342 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140Q13342 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140Q13342 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140Q13342 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140Q13342 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140Q13342 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140Q13342 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140Q13342 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140Q13342 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140Q13342 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140Q13342 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140Q13342 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140Q13342 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140Q13342 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140Q13342 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140Q13342 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140Q13342 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140Q13342 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140Q13342 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140Q13342 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140Q13342 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140Q13342 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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