Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWF1Q12792 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms