Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 CAR1YPL111W 1002 nt7.24□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 FET4YMR319C 1659 nt7.24□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 RRP45YDR280W 918 nt7.23□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YMR155WYMR155W 1644 nt7.23□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 DPB2YPR175W 2070 nt7.23□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 NMD5YJR132W 3147 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YDL023CYDL023C 321 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YHR140WYHR140W 720 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 SFC1YJR095W 969 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YKL031WYKL031W 414 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 LST8YNL006W 912 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 SSO1YPL232W 873 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 ARR3YPR201W 1215 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 IES1YFL013C 2079 nt7.22□□□□□ -1.25
NYV1Q12255 YIR042CYIR042C 711 nt7.21□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 MRPL13YKR006C 795 nt7.21□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 ERG3YLR056W 1098 nt7.21□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 TEA1YOR337W 2280 nt7.21□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 MKK1YOR231W 1527 nt7.21□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 PYC2YBR218C 3543 nt7.21□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 MSS116YDR194C 1995 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 AIM3YBR108W 2844 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 ADE13YLR359W 1449 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 CCR4YAL021C 2514 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 ATG4YNL223W 1485 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 MLC1YGL106W 450 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 RRP4YHR069C 1080 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 GUF1YLR289W 1938 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 CNE1YAL058W 1509 nt7.2□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 MSN2YMR037C 2115 nt7.19□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 KNH1YDL049C 807 nt7.19□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.19□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 NDE1YMR145C 1683 nt7.19□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 PAP1YKR002W 1707 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 COS6YGR295C 1146 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 BCY1YIL033C 1251 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 PAN6YIL145C 930 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 YLR194CYLR194C 765 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 YBR144CYBR144C 315 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 YMR027WYMR027W 1413 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 HSM3YBR272C 1443 nt7.18□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 HMS2YJR147W 1077 nt7.17□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 YOR342CYOR342C 960 nt7.17□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 RPL21AYBR191W 483 nt7.17□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 PSY4YBL046W 1326 nt7.17□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 GUD1YDL238C 1470 nt7.17□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 APM4YOL062C 1476 nt7.17□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 CDC10YCR002C 969 nt7.16□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 YNR042WYNR042W 429 nt7.16□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 ECM2YBR065C 1095 nt7.16□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 YMR010WYMR010W 1218 nt7.15□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 TFB4YPR056W 1017 nt7.15□□□□□ -1.26
NYV1Q12255 TRP1YDR007W 675 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 TRR1YDR353W 960 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YGL235WYGL235W 537 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 COX5AYNL052W 462 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 CNM67YNL225C 1746 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 MRPL36YBR122C 534 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 JIP4YDR475C 2631 nt7.14□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt7.13□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 OPI8YKR035C 642 nt7.13□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 GLN1YPR035W 1113 nt7.13□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YCL041CYCL041C 495 nt7.13□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 PRP2YNR011C 2631 nt7.13□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 ARO10YDR380W 1908 nt7.12□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YDL114WYDL114W 927 nt7.12□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YBL070CYBL070C 321 nt7.12□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 RPS9AYPL081W 594 nt7.12□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 PGM1YKL127W 1713 nt7.12□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 PET112YBL080C 1626 nt7.12□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 GYP8YFL027C 1494 nt7.11□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 SES1YDR023W 1389 nt7.11□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 EFM1YHL039W 1758 nt7.11□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 GIR2YDR152W 798 nt7.11□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 COA1YIL157C 594 nt7.11□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 JJJ3YJR097W 519 nt7.11□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YGL036WYGL036W 2730 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 SEC23YPR181C 2307 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 GGC1YDL198C 903 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 BSC4YNL269W 396 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 DEF1YKL054C 2217 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 KIN1YDR122W 3195 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 KKQ8YKL168C 2175 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 FRT1YOR324C 1809 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 RSC2YLR357W 2670 nt7.1□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YDR154CYDR154C 351 nt7.09□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YRA1YDR381W 681 nt7.09□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 PRM10YJL108C 1152 nt7.09□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YLR283WYLR283W 945 nt7.09□□□□□ -1.27
NYV1Q12255 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms