Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 CIN2YPL241C 807 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 AOS1YPR180W 1044 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 VHS1YDR247W 1386 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SAC7YDR389W 1965 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 RCK1YGL158W 1539 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 LAS17YOR181W 1902 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 DSD1YGL196W 1287 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SER2YGR208W 930 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SPO7YAL009W 780 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 AIM1YAL046C 357 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 ADH3YMR083W 1128 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CSI2YOL007C 1026 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SPE2YOL052C 1191 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 RCR1YBR005W 642 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SAS5YOR213C 747 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SPS4YOR313C 1017 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 MDM31YHR194W 1740 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CLN2YPL256C 1638 nt8.29□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 NDE1YMR145C 1683 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CDC16YKL022C 2523 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 DFG5YMR238W 1377 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 HGH1YGR187C 1185 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 PRP21YJL203W 843 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YAR069CYAR069C 294 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 MRPL16YBL038W 699 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 TPT1YOL102C 693 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 MET30YIL046W 1923 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YNR066CYNR066C 1311 nt8.28□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YKL133CYKL133C 1392 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 NRG1YDR043C 696 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 PSF2YJL072C 642 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 TOM7YNL070W 183 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 SNN1YNL086W 309 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 NRK1YNL129W 723 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 RFC4YOL094C 972 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YPL014WYPL014W 1146 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 SUR1YPL057C 1149 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 snR19snR19 568 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 MUD1YBR119W 897 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 ENO2YHR174W 1314 nt8.27□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 PAP1YKR002W 1707 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YEL023CYEL023C 2049 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 AIM6YDL237W 1173 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 LSM4YER112W 564 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YGL230CYGL230C 444 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 SMD2YLR275W 333 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YPL102CYPL102C 303 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 NPP2YEL016C 1482 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 SHM1YBR263W 1473 nt8.26□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 HTS1YPR033C 1641 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 PAD1YDR538W 729 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 BMH1YER177W 804 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YGL132WYGL132W 336 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YLR225CYLR225C 1224 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YNR064CYNR064C 873 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 SEC12YNR026C 1416 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 VRP1YLR337C 2454 nt8.25□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 FRT1YOR324C 1809 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 PRP19YLL036C 1512 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 PRP38YGR075C 729 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 AIM18YHR198C 966 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 SRP102YKL154W 735 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 SUB1YMR039C 879 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 ODC1YPL134C 933 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 TRP2YER090W 1524 nt8.24□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 RPT3YDR394W 1287 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YER186CYER186C 921 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 TPC1YGR096W 945 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 COS8YHL048W 1146 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 PML1YLR016C 615 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 MIC27YNL100W 705 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YOR283WYOR283W 693 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YPL261CYPL261C 309 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 MCH1YDL054C 1461 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 DXO1YDR370C 1329 nt8.23□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 AFG2YLR397C 2343 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 CPR1YDR155C 489 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YIL082WYIL082W 873 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 GPN3YLR243W 819 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 YPR109WYPR109W 885 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 RRP7YCL031C 894 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 ZAP1YJL056C 2643 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 MRS6YOR370C 1812 nt8.22□□□□□ -1.09
TFB4Q12004 RVS161YCR009C 798 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 snR63snR63 255 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YCR108CYCR108C 192 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SKI8YGL213C 1194 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YJR157WYJR157W 363 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 DID4YKL002W 699 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 BUD20YLR074C 501 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YML119WYML119W 1074 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PRS4YBL068W 981 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 GAL7YBR018C 1101 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 FIG1YBR040W 897 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SDS24YBR214W 1584 nt8.21□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RSA4YCR072C 1548 nt8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.7 ms