Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM1Q08AH1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM1Q08AH1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms