Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL18Q07020 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL18Q07020 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms