Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNG1Q06432 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG1Q06432 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG1Q06432 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms