Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 DID2YKR035W-A 615 nt5.92□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 PEX13YLR191W 1161 nt5.92□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 DDC1YPL194W 1839 nt5.92□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 CCZ1YBR131W 2115 nt5.92□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 YOR200WYOR200W 399 nt5.91□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 VMS1YDR049W 1899 nt5.91□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 YLL067CYLL067C 3618 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 RSC2YLR357W 2670 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 RHO3YIL118W 696 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 APN1YKL114C 1104 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 YML6YML025C 861 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 CAF40YNL288W 1122 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 UIP4YPL186C 915 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 ENV7YPL236C 1095 nt5.9□□□□□ -1.46
RRN11Q04712 OPT1YJL212C 2400 nt5.9□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 KDX1YKL161C 1302 nt5.9□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 THI2YBR240C 1353 nt5.9□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 SIT4YDL047W 936 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 VAM7YGL212W 951 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YHL018WYHL018W 363 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 RPP1YHR062C 882 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 SQT1YIR012W 1296 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 RPS3YNL178W 723 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 ARO7YPR060C 771 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 CCC2YDR270W 3015 nt5.89□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 TPO3YPR156C 1869 nt5.88□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 MAK31YCR020C-A 267 nt5.88□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 ECM14YHR132C 1293 nt5.88□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.88□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 AIM24YJR080C 1185 nt5.88□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 SEN34YAR008W 828 nt5.88□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 GPA2YER020W 1350 nt5.88□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 BUD32YGR262C 786 nt5.87□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 POP5YAL033W 522 nt5.87□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 RMA1YKL132C 1293 nt5.87□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YLR296WYLR296W 327 nt5.87□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 MSY1YPL097W 1479 nt5.87□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 SKS1YPL026C 1509 nt5.87□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 ILV1YER086W 1731 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 MKK2YPL140C 1521 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 CRP1YHR146W 1398 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 LYS21YDL131W 1323 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 CLP1YOR250C 1338 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 HEM2YGL040C 1029 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 NPA3YJR072C 1158 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 GCV3YAL044C 513 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YLR123CYLR123C 330 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 PUS5YLR165C 765 nt5.86□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 NOP2YNL061W 1857 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YET3YDL072C 612 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 LCP5YER127W 1074 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 LDS1YAL018C 978 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YNL285WYNL285W 372 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 TAX4YJL083W 1815 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 UTP4YDR324C 2331 nt5.85□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 DOT5YIL010W 648 nt5.84□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 ICS3YJL077C 396 nt5.84□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 LCB3YJL134W 1230 nt5.84□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 YLR312CYLR312C 1197 nt5.84□□□□□ -1.47
RRN11Q04712 UTP9YHR196W 1728 nt5.83□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 ICL1YER065C 1674 nt5.83□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 SEC17YBL050W 879 nt5.83□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 YNL165WYNL165W 1221 nt5.83□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 RKI1YOR095C 777 nt5.83□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 YMR027WYMR027W 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 RBA50YDR527W 1320 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 EXG1YLR300W 1347 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 BUG1YDL099W 1026 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 DMA1YHR115C 1251 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 BUD14YAR014C 2130 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 PDR16YNL231C 1056 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 ENV9YOR246C 993 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 MOD5YOR274W 1287 nt5.82□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 PPR1YLR014C 2715 nt5.81□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 ERP5YHR110W 639 nt5.81□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 RPO26YPR187W 468 nt5.81□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 snR32snR32 188 nt5.81□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 FOB1YDR110W 1701 nt5.81□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 DBP9YLR276C 1785 nt5.8□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 MAL11YGR289C 1851 nt5.8□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 YDL129WYDL129W 876 nt5.8□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 EGD2YHR193C 525 nt5.8□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 RPS5YJR123W 678 nt5.8□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 SHP1YBL058W 1272 nt5.8□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 VPS61YDR136C 573 nt5.79□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 DUS4YLR405W 1104 nt5.79□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 KTR1YOR099W 1182 nt5.79□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 PDB1YBR221C 1101 nt5.79□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 AMD2YDR242W 1650 nt5.79□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 VAN1YML115C 1608 nt5.78□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 RSC30YHR056C 2652 nt5.78□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 NCS6YGL211W 1080 nt5.78□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 SNN1YNL086W 309 nt5.78□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 NRM1YNR009W 750 nt5.78□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 RRS1YOR294W 612 nt5.78□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 YMC1YPR058W 924 nt5.78□□□□□ -1.48
RRN11Q04712 MRC1YCL061C 3291 nt5.77□□□□□ -1.49
RRN11Q04712 PWP1YLR196W 1731 nt5.77□□□□□ -1.49
RRN11Q04712 COX9YDL067C 180 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms