Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELAQ04206 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELAQ04206 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELAQ04206 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELAQ04206 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELAQ04206 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELAQ04206 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELAQ04206 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELAQ04206 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELAQ04206 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RELAQ04206 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RELAQ04206 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELAQ04206 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELAQ04206 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELAQ04206 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELAQ04206 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELAQ04206 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELAQ04206 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELAQ04206 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELAQ04206 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELAQ04206 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELAQ04206 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RELAQ04206 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELAQ04206 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RELAQ04206 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RELAQ04206 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELAQ04206 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELAQ04206 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RELAQ04206 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RELAQ04206 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RELAQ04206 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RELAQ04206 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RELAQ04206 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RELAQ04206 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RELAQ04206 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RELAQ04206 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELAQ04206 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RELAQ04206 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RELAQ04206 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RELAQ04206 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELAQ04206 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RELAQ04206 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RELAQ04206 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RELAQ04206 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms