Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A2Q01362 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A2Q01362 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms