Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
MDM2Q00987 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MDM2Q00987 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MDM2Q00987 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MDM2Q00987 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MDM2Q00987 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MDM2Q00987 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MDM2Q00987 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MDM2Q00987 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MDM2Q00987 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MDM2Q00987 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MDM2Q00987 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MDM2Q00987 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MDM2Q00987 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MDM2Q00987 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MDM2Q00987 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MDM2Q00987 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MDM2Q00987 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MDM2Q00987 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MDM2Q00987 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MDM2Q00987 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MDM2Q00987 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MDM2Q00987 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MDM2Q00987 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MDM2Q00987 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MDM2Q00987 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MDM2Q00987 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MDM2Q00987 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MDM2Q00987 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MDM2Q00987 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MDM2Q00987 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MDM2Q00987 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms