Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYBPC1Q00872 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYBPC1Q00872 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms