Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK16Q00536 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms