Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX1P83916 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX1P83916 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX1P83916 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX1P83916 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX1P83916 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX1P83916 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX1P83916 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX1P83916 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX1P83916 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX1P83916 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX1P83916 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX1P83916 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX1P83916 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX1P83916 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX1P83916 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX1P83916 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CBX1P83916 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX1P83916 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX1P83916 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX1P83916 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX1P83916 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX1P83916 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX1P83916 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX1P83916 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX1P83916 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX1P83916 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX1P83916 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX1P83916 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX1P83916 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX1P83916 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX1P83916 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX1P83916 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX1P83916 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CBX1P83916 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CBX1P83916 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX1P83916 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX1P83916 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX1P83916 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX1P83916 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX1P83916 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX1P83916 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX1P83916 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX1P83916 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX1P83916 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX1P83916 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX1P83916 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX1P83916 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX1P83916 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX1P83916 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX1P83916 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX1P83916 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX1P83916 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX1P83916 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX1P83916 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms