Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP2P81877 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP2P81877 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms