Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBA1P69905 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBA1P69905 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBA1P69905 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBA1P69905 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBA1P69905 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBA1P69905 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBA1P69905 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBA1P69905 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBA1P69905 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBA1P69905 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBA1P69905 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBA1P69905 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBA1P69905 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBA1P69905 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBA1P69905 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBA1P69905 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBA1P69905 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBA1P69905 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBA1P69905 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBA1P69905 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBA1P69905 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBA1P69905 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HBA1P69905 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBA1P69905 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBA1P69905 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HBA1P69905 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HBA1P69905 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HBA1P69905 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBA1P69905 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBA1P69905 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBA1P69905 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBA1P69905 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBA1P69905 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBA1P69905 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBA1P69905 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBA1P69905 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBA1P69905 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBA1P69905 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBA1P69905 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBA1P69905 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HBA1P69905 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HBA1P69905 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HBA1P69905 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HBA1P69905 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HBA1P69905 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HBA1P69905 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBA1P69905 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBA1P69905 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HBA1P69905 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HBA1P69905 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HBA1P69905 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HBA1P69905 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HBA1P69905 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms