Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRPNP63162 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPNP63162 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms