Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4XP62701 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4XP62701 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4XP62701 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4XP62701 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4XP62701 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4XP62701 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPS4XP62701 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4XP62701 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms