Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CAP62136 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms