Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL27P61353 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL27P61353 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27P61353 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27P61353 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27P61353 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27P61353 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27P61353 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27P61353 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27P61353 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27P61353 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27P61353 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27P61353 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27P61353 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27P61353 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27P61353 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL27P61353 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL27P61353 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL27P61353 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL27P61353 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27P61353 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL27P61353 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL27P61353 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL27P61353 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL27P61353 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL27P61353 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL27P61353 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL27P61353 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL27P61353 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL27P61353 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL27P61353 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL27P61353 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL27P61353 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL27P61353 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL27P61353 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL27P61353 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL27P61353 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL27P61353 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27P61353 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27P61353 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27P61353 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL27P61353 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27P61353 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27P61353 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL27P61353 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL27P61353 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL27P61353 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL27P61353 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL27P61353 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27P61353 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL27P61353 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27P61353 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27P61353 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms