Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCDC1P59894 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCDC1P59894 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms