Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EEFSECP57772 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.3 ms