Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB25P57735 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB25P57735 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB25P57735 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB25P57735 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB25P57735 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB25P57735 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB25P57735 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB25P57735 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB25P57735 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB25P57735 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB25P57735 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB25P57735 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB25P57735 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB25P57735 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB25P57735 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB25P57735 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB25P57735 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB25P57735 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB25P57735 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB25P57735 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB25P57735 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB25P57735 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB25P57735 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB25P57735 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB25P57735 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB25P57735 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB25P57735 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB25P57735 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB25P57735 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB25P57735 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB25P57735 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB25P57735 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB25P57735 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB25P57735 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB25P57735 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms