Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX9P55771 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX9P55771 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX9P55771 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX9P55771 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX9P55771 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX9P55771 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX9P55771 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX9P55771 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX9P55771 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX9P55771 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX9P55771 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX9P55771 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX9P55771 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX9P55771 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX9P55771 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX9P55771 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX9P55771 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX9P55771 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX9P55771 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX9P55771 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX9P55771 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX9P55771 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX9P55771 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX9P55771 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX9P55771 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX9P55771 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX9P55771 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX9P55771 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX9P55771 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX9P55771 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX9P55771 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX9P55771 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX9P55771 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX9P55771 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX9P55771 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX9P55771 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX9P55771 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX9P55771 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX9P55771 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX9P55771 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX9P55771 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX9P55771 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX9P55771 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX9P55771 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX9P55771 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX9P55771 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX9P55771 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX9P55771 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX9P55771 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX9P55771 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX9P55771 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX9P55771 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX9P55771 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX9P55771 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX9P55771 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms