Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAP1L1P55209 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAP1L1P55209 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms