Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF10P55107 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF10P55107 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF10P55107 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF10P55107 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF10P55107 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF10P55107 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF10P55107 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF10P55107 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF10P55107 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF10P55107 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF10P55107 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF10P55107 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF10P55107 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF10P55107 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF10P55107 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF10P55107 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF10P55107 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF10P55107 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF10P55107 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF10P55107 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF10P55107 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF10P55107 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF10P55107 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF10P55107 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF10P55107 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF10P55107 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF10P55107 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF10P55107 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF10P55107 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF10P55107 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF10P55107 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF10P55107 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF10P55107 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF10P55107 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF10P55107 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF10P55107 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF10P55107 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF10P55107 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF10P55107 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF10P55107 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF10P55107 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF10P55107 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF10P55107 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF10P55107 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF10P55107 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF10P55107 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF10P55107 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF10P55107 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF10P55107 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF10P55107 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF10P55107 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF10P55107 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF10P55107 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF10P55107 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF10P55107 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF10P55107 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF10P55107 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF10P55107 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF10P55107 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF10P55107 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF10P55107 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF10P55107 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF10P55107 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF10P55107 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF10P55107 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF10P55107 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF10P55107 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF10P55107 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF10P55107 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF10P55107 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF10P55107 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF10P55107 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF10P55107 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF10P55107 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF10P55107 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF10P55107 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF10P55107 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms