Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMP3P54852 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMP3P54852 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMP3P54852 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMP3P54852 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMP3P54852 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMP3P54852 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMP3P54852 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMP3P54852 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMP3P54852 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMP3P54852 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMP3P54852 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMP3P54852 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMP3P54852 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMP3P54852 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMP3P54852 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMP3P54852 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMP3P54852 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMP3P54852 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMP3P54852 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EMP3P54852 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EMP3P54852 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMP3P54852 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMP3P54852 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMP3P54852 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMP3P54852 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMP3P54852 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMP3P54852 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMP3P54852 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMP3P54852 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMP3P54852 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMP3P54852 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMP3P54852 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMP3P54852 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMP3P54852 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMP3P54852 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMP3P54852 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMP3P54852 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMP3P54852 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMP3P54852 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMP3P54852 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMP3P54852 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMP3P54852 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMP3P54852 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMP3P54852 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMP3P54852 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMP3P54852 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms